特殊房屋拆遷糾紛案如何處理

結合具體情況處理。在我國對於拆遷合同協議糾紛案件的糾紛處理有這些：依照《條例》規定，被拆遷人享有實行房屋產權調換的權利。
實踐中，大部分的拆遷安置合同都對新建安置用房的產權進行了約定。
在處理雙方因安置房產權發生糾紛時，合同有約定的，應按合同約定處理，但合同對新建安置用房沒有產權約定的，應按拆遷時的法規處理。
《國有土地上房屋徵收與補償條例》第十七條
作出房屋徵收決定的市、縣級人民政府對被徵收人給予的補償包括：
（一）被徵收房屋價值的補償；
（二）因徵收房屋造成的搬遷、臨時安置的補償；
（三）因徵收房屋造成的停產停業損失的補償。市、縣級人民政府應當制定補助和獎勵辦法，對被徵收人給予補助和獎勵。