房管局注销抵押房产证会不会没收

不会。房产抵押注销不会显示在房产证上的，抵押登记受理窗口的工作人员对抵押注销申请材料进行审核，材料无误后将在柜台当场办理注销手续。注销手续办理完毕后，将把《房屋权证》、《国有土地使用证》还给抵押人，其他注销材料由窗口的工作人员收存。
《房屋登记办法》第三十八条
《房屋登记办法》第三十九条