公司有官司可以注销吗

不能注销，因为法院会给工商发协查函冻结公司所有的变更、注销业务。工商不会受理的。
《公司法》第一百七十九条 公司合并或者分立，登记事项发生变更的，应当依法向公司登记机关办理变更登记;公司解散的，应当依法办理公司注销登记;设立新公司的，应当依法办理公司设立登记。
公司增加或者减少注册资本，应当依法向公司登记机关办理变更登记。