主债务超过诉讼时效抵押权如何处理

主债务超过诉讼时效，抵押权人丧失的是抵押权受人民法院保护的胜诉权的权利。抵押权本身未消失，抵押人自愿履行担保义务的，抵押权人仍可以行使抵押权。
根据《中华人民共和国民法典》四百一十九条规定：抵押权人应当在主债权诉讼时效期间行使抵押权；未行使的，人民法院不予保护。