結婚證只有一本有效嗎

有效的，可以作爲結婚的證據。
另外，也可以去補辦。《婚姻登記條例》第十七條規定：結婚證、離婚證遺失或者損毀的，當事人可以持戶口簿、身份證向原辦理婚姻登記的機關或者一方當事人常住戶口所在地的婚姻登記機關申請補領。婚姻登記機關對當事人的婚姻登記檔案進行查證，確認屬實的，應當爲當事人補發結婚證、離婚證。