夫妻公证的协议一般是有效的,除非有相反证据足以推翻该项公证的除外。根据《公证法》第三十六条的规定,经公证的民事法律行为、有法律意义的事实和文书,应当作为认定事实的根据,但有相反证据足以推翻该项公证的除外。