專利合同糾紛案的解決方法有:協商解決,訴訟解決。未經專利權人許可,實施其專利,即侵犯其專利權,引起糾紛的,由當事人協商解決。專利糾紛當事人不願協商或者協商不成的,專利權人或者利害關係人可以向人民法院起訴。法律依據:《民事訴訟法》第二十三條因合同糾紛提起的訴訟,由被告住所地或者合同履行地人民法院管轄。