商標侵權已賠償如何才能撤案

可以自行簽訂諒解協議，或者透過法院調解成功，然後由報案人主動申請撤案。
對於一般的商標侵權行爲，從法律關係上來說是屬於民事法律關係。因此，對於已經立了案的商標侵權案件，投訴人向工商行政管理機關主動申請撤訴的，如果管理機關只要還沒有作出行政處罰的決定的，那麼是可以不做出責令侵權人賠償被侵權人的經濟補償的決定的。假如是侵權人的行爲擾亂了正常的商標管理秩序的，那麼就應當根據具體的情況追究其法律責任。
《民事訴訟法》第一百四十五條，宣判前，原告申請撤訴的，是否准許，由人民法院裁定。