发生交通事故责任已经认定会扣留车辆吗

不会。依据我国相关法律的规定，交通事故责任认定书下来后，交警不能继续扣车，所扣车辆和物品及证照应在5日内交给车主。
交警扣车是为了收集证据调查交通事故，用于交通事故责任认定，比如对车辆进行技术鉴定等等，所以，发生交通事故责任已经认定就不能再扣车了。
《道路交通事故处理程序规定》第三十九条
《道路交通事故处理程序规定》第五十八条