一个商铺可以注册两个营业执照吗

可以。但是需要把地址分开，一个店面可以有两个营业执照，但一个营业执照只对应唯一地址，可以把一个店面间隔成两个店面，就能各办一个营业执照。隔成两个店面虽然共用一个门牌号码，但属于不同房间的地址，不视为同一地址。
法律依据：
《个体工商部管理办法》第十三条
申请个体工商户登记，申请人或者其委托的代理人可以直接到经营场所所在地登记机关登记；登记机关委托其下属工商所办理个体工商户登记的，到经营场所所在地工商所登记。