1、企业经营性房屋的补偿。
企业经营性房屋的补偿，包括企业厂房、仓库等所有建筑物，补偿的标准也以产权证中的建筑面积为准。具体的补偿价格涉及很多因素，包括建筑物的位置、建筑面积、建筑结构、建筑材质等等，需要综合考量。
2、房屋附属物的补偿。
企业房屋附属物是指附属于被拆迁房屋，由使用人在使用过程中为提高房屋使用效能而改造或追加的，不能异地使用或异地使用将影响其功能的财物及相关设施。附属物一般包括室内装修装饰、室外构筑物、地栽树木及花木、相关设备比如有线电视以及管道煤气(或天然气)出装费等。这些补偿都按照重置成本的价格进行补偿。
3、停产停业损失补偿。
企业拆迁的停产停业损失的补偿，需要满足营业执照、纳税登记、纳税记录等条件，具体包括两大方面，实际损失方面的补偿和逾期利益损失补偿。
4、机器设备的补偿。
机器设备包括可移动的和不可移动的，可移动的设备按照搬迁费标准计算，具体有拆卸费、运输费、安装调试费用等。不可移动的按照重置成本计算，需要根据设备型号以证明市场价格。
5、员工停工、遣散费用。
主要包括停工期间的工资和社保费用，遣散的员工需要解除劳动合同，依据劳动合同法进行经济补偿。
综上所述，企业房屋被政府拆迁，签订补偿协议后，政府要支付拆迁款给企业，这笔收入不是企业正常经营所得，不需要缴纳增值税。但是，企业应该缴纳企业所得税。企业房屋拆迁除了能够拿到房屋价值补偿外，还会有停业损失补偿及搬迁补偿等。
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