协议管辖违反专门管辖

受案范围，指公民、法人或者其他组织对具有国家行政职权的机关和组织及其工作人员的行政行为不服，依法提起诉讼的，属于人民法院行政诉讼的受案范围。公安机关和司法机关都有明确的管理范围，比如普通的基层法院不能审理涉外专利侵权案件，这在法律中有明确的规定，所以，当事人在起诉时候，一定要明确是否在该法院的受理范围。

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协议管辖不得违反一审级别管辖

我国一审案件的级别管辖是以涉案标的额的大小来划分的，各地的划分标准也是根据当地经济发展水平而单独制定的，地域间差距很大。但很多当事人签订合同之时(如签订长期买卖的一揽子协议)不能预料标的额一共有多少，也不知道应当属于哪一级法院主管。因此协议约定的管辖法院往往不能符合级别管辖的要求而无效。对于这种情况，笔者认为不能一味将协议否定，因为协议是双方真实意思表示，只是因为对法院内部的级别划分规定不够熟悉而约定错误，法院应最大程度的尊重当事人想要在某地相关法院起诉、应诉的意愿，例如，协议约定某地区基层法院审理，但标的额应属上一级法院管辖，当事人也愿意到约定基层法院的上一级法院起诉的，该中级法院应当受理，承认约定有效。这样灵活变通的方式可以保护很多协议管辖的约定有效。